Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM)

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• Surveillance de SARM
• Recherche sur SARM
• Biofilms et SARM

• Publications sur SARM
• Présentations par affiches sur SARM

Services de référence sur SARM

Le laboratoire sur la résistance aux antimicrobiens et les infections nosocomiales (RAIN) fournit des services de référence sur SARM à tous les laboratoires hospitaliers et laboratoires de santé publique du Canada. Les analyses sont offertes sur demande. Pour effectuer ces analyses, nous avons besoin d’un isolat pur.

Les activités du laboratoire comprennent notamment :

1. L’identification de SARM au moyen de méthodes microbiologiques classiques et de méthodes moléculaires de PCR multiplex en temps réel pour la détection simultanée des gènes mecA, nuc et PVL.
2. Des épreuves de sensibilité à l’égard de divers antimicrobiens par microdilution en bouillon et/ou E-Test.
3. Le typage moléculaire des souches pour les enquêtes sur des éclosions au moyen de l’électrophorèse en champ pulsé (ECP), du typage génomique multilocus et du typage spa.
4. La tenue à jour d’une base de données nationale renfermant plus de 10 000 empreintes de SARM produites par ECP.
5. Le typage de la cassette chromosomique mec du staphylocoque (SCC).
6. La caractérisation des mécanismes inhabituels ou rares de résistance à la vancomycine, au linézolide, au synercide ou à l’oritavancine.
7. L’analyse par PCR des toxines staphylococciques pour la détection de gènes codant pour les entérotoxines, les toxines exfoliatrices, la toxine du syndrome du choc toxique et la toxine PVL (leucocidine de Panton et Valentine).

Le laboratoire RAIN est prêt à mettre au point tout test nécessaire pour faire face à un problème émergent de résistance aux antimicrobiens ou pour collaborer à une enquête sur une éclosion d’infection nosocomiale.

Surveillance de SARM

Programme canadien de surveillance des infections nosocomiales (PCSIN)
IAmorcée en 1995, la surveillance de SARM s’effectue en collaboration avec le Programme canadien de surveillance des infections nosocomiales (PCSIN) cnisp.ca . Ce programme intégré de surveillance continue combine des données épidémiologiques et des données de laboratoire afin de brosser un tableau complet de la présence de SARM au Canada.

Simor A. E., M. Ofner-Agostini, D. Gravel, M. Varia, S. Paton, A. McGeer et coll. Surveillance de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline dans les hôpitaux canadiens – Bilan du Programme canadien de surveillance des infections nosocomiales, Relevé des maladies transmissibles au Canada, 2005;31(3);3340.

Ofner-Agostini M., A. E. Simor, M. Mulvey, E. Bryce, M. Loeb, A. McGeer, A. Kiss, S. Paton, and the Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program, Health Canada. 2006. Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Canadian Aboriginal People. Infection Control and Hospital Epidemiology. 27:204-207.

Simor A. E., M. Ofner-Agostini, S. Paton, A. McGeer, M. Loeb, E. Bryce, M. Mulvey, and the Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program (CNISP). 2005. Clinical and Epidemiologic Features of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Hospitalized Elderly Adults.  Infection Control and Hospital Epidemiology. 26:838-841.

Simor, A. E., M. Ofner-Agostini, E. Bryce, A. McGeer, S. Paton, M. R. Mulvey, and The Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program, Health Canada. 2002.  Laboratory Characterization of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus in Canadian Hospitals: The Results of Five Years of National Surveillance 1995-1999.  Journal of Infectious Diseases. 186:652-660.

Le PCSIN axe également ses efforts de surveillance sur SARM d’origine communautaire (SARMC) par le biais d’un projet de surveillance accrue. Les possibles cas d’infection communautaire à SARM, déterminés par un professionnel en prévention des infections, sont communiqués au laboratoire RAIN, et ce dernier analyse les échantillons par électrophorèse en champ pulsé (ECP) et PCR afin de confirmer la présence de SARM et de détecter la toxine PVL.

Il existe actuellement au Canada 10 souches épidémiques qui ont été identifiées au moyen des empreintes d’ECP. Le tableau ciaprès présente les caractéristiques de ces isolats et leurs liens avec d’autres souches épidémiques connues dans le monde.

Type épidémique	Autres noms (ECP)	MLST
SARMC1	USA600	ST45
SARMC2	USA100/USA800/New York	ST5
SARMC3		ST241
SARMC4	USA200/EMRSA16	ST36
SARMC5	USA500	ST8
SARMC6		ST239
SARMC7	USA400/MW2	ST1
SARMC8	EMRSA15	ST22
SARMC9		ST8
SARMC10	USA300	ST8

 

Étude cas-témoins sur SARM d’origine communautaire
Le Northern Antimicrobial Resistance Partnership (NARP) est un projet financé par les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC) qui vise à étudier l’usage des antimicrobiens et la résistance envers ces derniers dans les régions nordiques de la Saskatchewan. www.narp.ca
SARMC constitue un problème dans certaines régions de la Saskatchewan.
On a entrepris une étude cas-témoins afin de mieux comprendre les facteurs de risque d’infection à SARMC dans ces régions.
Pour obtenir des détails sur l’étude castémoins en cours, on peut cliquer sur le lien suivant. Case Control MRSA (Anglais) (Word)

SARM d’origine communautaire au Canada
SARMC7 - La souche épidémique SARMC7 (profil 0142) ne peut être distinguée de la souche USA400 (souche de S. aureus MW2 à l’origine d’une éclosion au Minnesota et au Dakota du Nord)[6], [7], [8].  Nous avons observé au Canada des souches SARMC7 (profil 0142) donnant un résultat positif ou négatif pour la toxine PVL. Les profils du groupe SARMC7 donnent un résultat positif ou négatif pour la toxine PVL.

SARMC10 - La souche épidémique SARMC10 (profil 0473) ne peut être distinguée d’un profil associé à de multiples éclosions d’infections à SARM d’origine communautaire aux ÉtatsUnis (USA300)[1], [2], [3], [4] Elle a aussi provoqué des éclosions dans l’Ouest canadien, particulièrement parmi les utilisateurs de drogues par injection et dans les établissements correctionnels5. Nous avons observé 167 fois le profil 0473 au Canada depuis l’an 2000. Toutes les souches SARMC10 (profil 0473) que nous avons analysées jusqu’à maintenant donnaient un résultat positif pour la toxine PVL, mais les profils du groupe SARMC10 ne donnent pas tous un résultat positif pour cette toxine.

Souche Southwest Pacific (SWP)/USA1100. D’après les comparaisons avec les publications récentes, le profil 0524 (obtenu par ECP) de la base de données nationale semble correspondre à la souche Southwest Pacific (SWP)/USA1100. La souche SWP a été associée à de multiples éclosions d’infections à SARM d’origine communautaire dans le monde [4], [9]. Ces souches sont bien connues comme des souches ST30 donnant un résultat positif pour la toxine PVL. Nous avons observé 4 fois le profil 0524 au Canada depuis l’an 2001.

Souche européenne de SARMC. Le profil 0534 de la base de données nationale ne peut être distingué d’un profil obtenu avec la souche européenne de SARMC10. Ces souches sont connues comme des souches ST80 donnant un résultat positif pour la toxine PVL. Nous avons observé 4 fois le profil 0534 au Canada depuis l’an 2001.

Références

1. Centers for Disease Control and Prevention. 2001. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus skin or soft tissue infections in a state prison, Mississippi, 2000. Morb. Mortal. Wkly. Rep. 50:919-922.
2. Centers for Disease Control and Preventions. 2003. Public health dispatch: outbreaks of community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus skin infections,  Los Angeles, California, 2002-2003. Morb. Mortal. Wkly. Rep. 52:88.
3. Seybold, U, et al. 2006. Emergence of community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus USA300 genotype as a major cause of health care-associated blood stream infections.  Clin. Inf. Dis. 42:647-656.
4. Tenover FC, et al. 2006. Characterization of a strain of community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus widely disseminated in the United States. J. Clin. Microbiol. 44:108-118.
5. Main, CL, et al. 2005. Outbreaks of infection caused by community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus in a Canadian correctional facility. Can. J. Infect. Dis. Med. Microbiol. 16:343-348.
6. Hunt, C. et. al. 1999. Four pediatric deaths from community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus- Minnesota and North Dakota, 1997-1999. Morb. Mortal. Wkly. Rep. 48:707-710.
7. Mulvey, MR, et. al. 2005. Community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Canada. Emerg. Inf. Dis. 11:844-850.
8. Wylie, JL and DL Nowicki. 2005. Molecular epidemiology of community- and health care-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Manitoba, Canada. J. Clin. Microbiol. 43:2830-2836.
9. Robinson DA, et al. 2005. Re-emergence of early pandemic Staphylococcus aureus as a community-acquired methicillin-resistant clone. Lancet 365:1256-1258.
10. Faria NA, et al. 2005. Epidemiology of emerging methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Denmark: a nationwide study in a country with low prevalence of MRSA infection. J. Clin. Microbiol. 43:1836-1842.

Recherche sur SARM

Mise au point de méthodes

1. n collaboration avec le laboratoire de santé publique de la Saskatchewan, nous avons mis au point une épreuve de PCR multiplex en temps réel pour identifier les souches de S. aureus (nuc) porteuses du gène de résistance à la méthicilline (mecA). L’épreuve permet aussi de détecter une toxine (PVL) associée aux souches de SARMC. Publication McDonald JCM, 2005 (Anglais)
2. Nous collaborons actuellement avec le Dr Gilmour, du Laboratoire national de microbiologie, à la mise au point d’une épreuve simple de type Luminex en vue de l’identification rapide de plus d’une douzaine de toxines staphylococciques.

Étude de la « nature épidémique » de SARM
Un étudiant diplômé utilise actuellement des puces à ADN représentant tout le contenu génétique de la souche COL afin de comparer le contenu génétique des souches épidémiques canadiennes de SARM à celui d’isolats sporadiques de SARM. Un manuscrit est en cours de rédaction.

Voici quelques exposés qui ont été présentés sur cette étude.

Christianson, S., M. R. Mulvey. Étude d’hybridation génomique comparative de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline au Canada. Premier forum de recherche annuel de l’Agence de santé publique du Canada (ASPC), Hôtel Fort Gary, Winnipeg (Manitoba), les 21 et 22 mars 2006.  (Anglais)

Christianson, S., M. R. Mulvey.  Comparative Genomic Hybridizations of Hospital and Community-Associated MRSA in Canada.  45th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC), Washington, DC, December 16 – 19, 2005. (Anglais)

Biofilms et SARM

Nous collaborons avec le Dr S. Jones de l’Université de Calgary à une étude visant à déterminer la capacité des souches épidémiques canadiennes identifiées de SARM (SARMC) à former des biofilms. Les données obtenues au moyen des puces à ADN dans le cadre de l’étude susmentionnée seront liées à la capacité des souches à former des biofilms. D’autres études concernant l’expression génique chez les microorganismes sous forme planctonique et sous forme de biofilm seront menées.