Programme des maladies entériques

Le Programme des maladies entériques (chef : Dr Matthew W. Gilmour) offre des services de laboratoire de référence à l’échelle nationale et des programmes de recherche exhaustifs qui contribuent à notre leadership en matière de systèmes de surveillance en temps réel et d’intervention en cas d’éclosion de maladies d’origine alimentaire et hydrique. Parmi les programmes et les services offerts figurent le Programme national de surveillance des maladies entériques et le réseau PulseNet Canada.

Identification et sérotypage

L’identification des bactéries au genre et à l’espèce constitue la première étape de toute enquête de nature bactériologique, et l’unité d’identification et de sérotypage (chef : Helen Tabor) possède l’expérience et l’expertise nécessaires pour fournir des services d’identification biochimique d’importants pathogènes transmissibles par les aliments et l’eau tels que :

• Listeria
• Salmonella
• Escherichia
• Shigella
• Campylobacter
• Vibrio
• Aeromonas
• Tous les autres isolats Gram négatif

Notamment, l’unité d’identification et de sérotypage est l’une des rares dans le monde qui possède l’expérience, l’expertise et les collections de bactéries de référence nécessaires pour préparer et effectuer des contrôles de qualité rigoureux du sérotypage de Salmonella, Shigella, Vibrio, E. coli et Listeria monocytogenes avec des antisérums de lapin.

La section entérique fournit également un service de référence en matière de recherche de toxines et, grâce à des approches moléculaires telles que la PCR et à des approches phénotypiques telles que les tests de cytotoxicité en culture tissulaire et les tests de neutralisation, la section peut identifier les souches toxicogènes de E. coli, de Shigella, de Vibrio, de Klebsiella et d’autres espèces bactériennes.

Lysotypage

L’unité de lysotypage (chef : Rafiq Ahmed) du Programme des maladies entériques effectue des analyses de laboratoire, produit des bactériophages et mène des activités de recherche appliquée et de surveillance relativement aux agents pathogènes entériques, dont :

• E. coli O157 (productrice de toxine Shiga)
• Salmonella enterica sérovars Enteritidis, Typhimurium, Heidelberg, Infantis, Newport, Paratyphi B, Oranienburg, Hadar, Panama, Thompson et Typhi
• Shigella boydii et Shigella sonnei

Le lysotypage s’est révélé une méthode économique, fiable et instructive pour la détection des grappes de cas et des éclosions de maladies entériques et les interventions connexes, et s’appuie sur des données recueillies pendant plus de soixante ans. Les programmes de surveillance et d’intervention en cas d’éclosion utilisent souvent les données sur le lysotypage en association avec les données obtenues par sérotypage et par analyse des empreintes génétiques par ECP. La majorité des mécanismes de typage ont été élaborés et normalisés au Canada, et les autres ont été obtenus de l’Agence de la santé publique du Royaume-Uni.

PulseNet Canada

PulseNet Canada (chef : Dre Celine Nadon) représente un partenariat actif entre l’ASPC, l’ACIA , Santé Canada et les laboratoires de santé publique provinciaux (représentés par le Réseau des laboratoires de santé publique du Canada [RLSPC] ) dont le mandat consiste à détecter en temps réel les éclosions de maladies d’origine alimentaire et à procéder aux interventions nécessaires.

Visitez le site Web de PulseNet Canada pour obtenir de plus amples renseignements.

Recherche

Unité de recherche sur les maladies entériques

La dernière génération de technologies génomiques et protéomiques révolutionne les enquêtes de santé publique sur les maladies causées par des agents pathogènes bactériens chez l’humain. Le Programme des maladies entériques mène des programmes de recherche appliquée sur des méthodes génomiques et protéomiques à haut débit dans le but de renforcer les activités de diagnostic, de surveillance et de lutte, permettant la réalisation d’enquêtes d’épidémiologie moléculaire améliorées sur les isolats bactériens d’origine clinique, alimentaire et environnementale. Le but de ces projets est d’officialiser l’utilisation des outils technologiques et informatiques et de les intégrer dans nos travaux en santé publique de façon à ce que des analyses pathogénomiques comparatives portant sur le génome entier puissent être mises en œuvre pour assurer la fiabilité et améliorer le rendement du sous-typage, de la traçabilité et de la surveillance des agents pathogènes d’origine alimentaire et hydrique.

Dans le cadre de nos programmes de pathogénomique, nous menons également des activités de recherche axées sur la découverte qui utilisent des données issues d’analyses génomiques et métagénomiques à haut débit en association avec des études protéomiques et fonctionnelles afin d’étudier la diversité des agents pathogènes, les facteurs de virulence, l’interaction pathogène-hôte et d’autres facteurs relatifs aux pathogènes à l’origine des maladies infectieuses. Ces études nous permettent de mener des travaux de recherche fondamentale sur la persistance des bactéries pathogènes entériques dans l’environnement et leurs mécanismes de virulence.

Voici des exemples de ces travaux :

• Gilmour MW, Graham M, Van Domselaar G,Tyler S, Kent H, Trout-Yakel KM, Larios O, Allen V, Lee B, Nadon C (2010). High-throughput genome sequencing of two Listeria monocytogenes clinical isolates during a large foodborne outbreak, BMC Genomics, 11:120
• Listeria monocytogenes 08-5578, complete genome
• Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578, complete sequence
• Listeria monocytogenes 08-5923, complete genome

Contactez-nous

Programme des maladies entériques
Laboratoire national de microbiologie
Agence de la santé publique du Canada
Centre scientifique canadien de santé humaine et animale
1015, rue Arlington
Winnipeg (Manitoba)  R3E 3R2
Tél. : 204-784-5920
Téléc. : 204-789-5012
Courriel : NML.Enterics@phac-aspc.gc.ca